目前多按肛管與括約肌的關系將肛瘺的癥狀分為4類，下面就詳細的介紹一下肛瘺的癥狀：
    1、括約肌間肛瘺　多為低位肛瘺，最常見，約占70%，為肛管周圍膿腫的后果，瘺管只穿過內括約肌，外口常只有一個，距肛緣較近，約3～5cm，少數瘺管向上，在直腸環肌和縱肌之間形成盲端或穿入直腸形成高位括約肌間瘺。
    2、經括約肌肛瘺　可以為低位或高位肛瘺，約占25%，為坐骨直腸窩膿腫的后果，瘺管穿過內括約肌，外括約肌淺部和深部之間，外口常有數個，并有支管互相溝通，外口距肛緣較近，約5cm左右，少數瘺管向上穿過肛提肌到直腸旁結締組織內，形成骨盆直腸瘺。
    3、括約肌上肛瘺　為高位肛瘺，少見，占5%，瘺管向上穿過肛提肌，然后向下至坐骨直腸窩穿透皮膚，由于瘺管常累及肛管直腸環，故治療較困難，常需分期手術。
    4、括約肌外肛瘺　最少見，占1%，為骨盆直腸膿腫合并坐骨直腸窩膿腫的后果，瘺管穿過肛提肌直接與直腸相通，這種肛瘺常由于克隆病，腸癌或外傷所致。
    肛瘺的癥狀是一種比較復雜的肛腸病，其治療方法是行肛瘺手術。肛瘺的治療要注意其原發病灶，以上分類在高低位方面較細致，有利于手術方法的選擇。