區內共有野生動物1555種，其中鳥類296種。國家一級重點保護鳥類有丹頂鶴、白頭鶴、白鶴、大鴇、東方白鸛、黑鸛、金雕、白尾海雕、中華秋沙鴨、遺鷗10種，國家二級保護鳥類有灰鶴、白枕鶴、大天鵝、小天鵝、白琵鷺等49種。

    區內共有種子植物393種，其中野生種子植物116種。天然蘆葦2.7萬公頃，天然草地1.2萬公頃，是中國沿海最大的新生濕地自然植被區。

    黃河口地形地貌和獨特的自然資源形成了以“奇、特、曠、野、新”為主要美學特征的自然景觀和生態旅游資源。